宏基因组

宏基因组指特定环境中全部微生物的总DNA基因组，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。

服务简介

宏基因组测序以 Illumina、华大等高通量测序平台为核心技术支撑，通过对环境样品中所有微小生物的基因组 DNA 进行全面测序，可系统解析微生物群体的物种组成、功能多样性及群落结构变异，深入探究微生物与环境、宿主间的相互作用，同时为发掘和研究新型功能基因或物种提供关键数据支持。

检测指标

样品采集、处理、运输

土壤样本：采样时去除表面浮土，使用消毒灭菌处理的铲子挖取地下 5-20 cm 的土层，去除可见杂质，如石块、草根等，使用 5 mL 或 15 mL 无菌离心管装载样本，并用封口袋密封。

水体样本：采样体积根据水样的浑浊程度选择相应孔径的 47mm 滤膜过滤，截留0.1-2 L 水中的微生物。过滤后，滤膜含微生物一面，向内卷曲后贴于收集管壁保存，滤膜冻干后，用大体积干冰运输。

组织样本（如动物组织、植物组织）建议取样后立即液氮速冻 3-5min，-80°C长期保存，干冰运输送样。其它样本类型及运输条件请与实验室沟通。

部分结果展示

Venn图
注：重叠部分表示多个样本分组中共有的物种，没有重叠的部分表示该样本分组所特有的物种，数字表示对应的物种数目。

Heatmap图

注：热图下侧和右侧分别为样本名称和物种名称，如果进行了聚类分析左侧和上侧分别为物种聚类树和样本聚类树。热图中颜色的深浅分别代表物种丰度的高低。

Circos图

注：左边半圆（较小圈）表示样本的物种丰度组成情况，右边半圆（较大圈）表示在该聚类水平下物种在不同样本中的分布比例情况。圆圈从外到内：第一、二彩色圈：左半部分圆圈表示不同样本对应的物种组成，不同颜色表示不同物种，长度代表某一物种在该样本中的丰度比例（第二圈内显示的百分比）；右半部分圆圈表示不同样本在优势物种中的分布比例，不同颜色表示不同样本，长度代表该样本在某一物种中的分布比例（第二圈内显示的百分比）；第三圈：圈内的彩色条带，一端连接样本（左边半圆），条带端点宽度表示物种在该样本中的丰度，另一端连接物种（右边半圆），条带端点宽度表示该样本在相应物种中的分布比例，圈外数值表示相应物种的丰度数值。

PCA图

注：横、纵坐标表示两个选定的主坐标成分，百分比表示主坐标成分对样本组成差异的贡献值。横、纵坐标轴的刻度是相对距离，无实际意义。不同颜色或形状的点代表不同分组的样本，两样本点越接近，表明两样本物种组成越相似。