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植物多组学分析

代谢组学分析依托高分辨质谱,精准定量植物内源激素、酚酸、黄酮、氨基酸等各类小分子代谢物,直观呈现生理表型对应的物质基础。转录组测序,全面检测样本中所有基因的表达水平,快速定位与目标性状(如抗逆、品质、药效)相关的关键功能基因与调控通路。

代谢组学分析依托高分辨质谱,精准定量植物内源激素、酚酸、黄酮、氨基酸等各类小分子代谢物,直观呈现生理表型对应的物质基础。转录组测序,全面检测样本中所有基因的表达水平,快速定位与目标性状(如抗逆、品质、药效)相关的关键功能基因与调控通路。

本服务通过两组学数据的关联分析,覆盖样本处理、测序检测、数据分析、结果解读全流程,打通“基因表达→代谢物合成→性状形成”的完整链路,明确核心调控基因与关键代谢物的对应关系,阐明植物生长发育、逆境胁迫响应、农产品品质提升、药用植物药效发挥的分子机理,为作物分子育种、药用植物品质改良、功能成分开发及高水平论文发表提供可靠、可落地的技术支撑。


服务优势

1、检测方法优先参照国家标准、行业标准,同时采用行业公认的成熟检测方法进行测定。

2、售前售中售后全流程提供多对一技术支持。

3、检测样品免费提供预处理服务。

4、检测过程严谨,免费做平行质控和标准物质质控,数据结果真实可靠。

5、检测流程全透明:检测过程中,客户可通过用户中心实时查看项目检测进度;检测完成后,系统将自动通过邮件发送完整实验报告。

 

 检测指标

类别

指标

检测方法

样品要求

高通量靶向代谢

氨基酸类

HPLC-MSMS/HPLC

2g鲜样/1g干样

糖类(游离糖组分)

HPLC-MSMS

T6P(海藻糖-6-磷酸)

HPLC-MSMS

脂肪酸组分

GC/GC-MS

GC/GC-MS

多胺(精胺、亚精胺、腐胺、尸胺)

HPLC-MSMS

2g鲜样

有机酸组分(草酸、酒石酸、苹果酸、乳酸、乙酸、富马酸、柠檬酸、马来酸、琥珀酸、奎宁酸、莽草酸、丙二酸)

HPLC/HPLC-MSMS

2g鲜样/10mL液体

维生素(VA、VB、VE、VD等)

HPLC/HPLC-MSMS

脂溶性:2g鲜样/1g干样

水溶性:2g鲜样

核苷酸(ADP、ATP、AMP、GTP、GDP、IMP、XMP、CMP、UMP、GMP)

HPLC

2g鲜样

植物激素(游离态生长素、结合态生长素、生长素前体、脱落酸、游离态茉莉酸、结合态茉莉酸、茉莉酸前体、游离态水杨酸、结合态水杨酸、天然细胞分裂素、人工合成细胞分裂素、活性赤霉素、非活性赤霉素、油菜素内酯、独脚金内酯系列、乙烯相关(GC)、褪黑素相关)

HPLC-MSMS(同位素内标法)

3g新鲜样品/1g冻干样

(油菜素内酯/独脚金内酯:5g新鲜样品/2g冻干样;ACC/ACS:1g新鲜样品/0.5g冻干样;

乙烯:50mL气瓶或者气袋收集气体)

植物色素(花青素类、类胡萝卜素类、大豆异黄酮)

HPLC/HPLC-MSMS

花青素类:3g新鲜样品/2g冻干样

类胡萝卜素:2g新鲜样品/1g冻干样

大豆异黄酮:2g新鲜样品/1g干样(冻干/烘干)

植物甾醇(β谷甾醇、豆甾醇、菜油甾醇)

HPLC/HPLC-MSMS

2g新鲜样品/1g干样(冻干/烘干)

蛋氨酸循环相关氨基酸、缩合单宁组分、酚酸、花色苷类、皂苷类、生物碱、黄酮及黄酮类组分、硫苷类、儿茶素类及茶黄素、大蒜素、蒜氨酸等

HPLC/HPLC-MSMS

详情请咨询

萜类物质、木质素单体

GC-MS

2g新鲜样品/1g(冻干/烘干)样品

2-AP(2-乙酰-1-吡咯啉)

GC

水稻:2g新鲜样品/1g冻干样

非靶代谢组学

风味物质/挥发性物质非靶(醇类、醛类、酮类、酸类、酯类、酚类、醚类、萜类、烃类、芳香烃类、卤代烃类、胺类、杂环化合物、含氮化合物含硫化合物、生物碱)

SPME-GC-MS

10g植物鲜样;10g动物组织;2ml精油;2ml酒、汤、尿液等液体;植物每组至少做3次生物学重复,动物每组至少做6次生物学重复,才可做组学分析

果皮蜡质组分(酯类、酸类、酮类烃类、醛类、酰胺类、萜类、醇类、脂肪酸类)

GC-MS

只测蜡质总量时表面积型样本:叶片/花瓣-提供标准面积100cm2左右(禁忌:破损、卷曲、液渍残留);

果实类,提供完整果实,如只关注果实上黑斑、锈斑等局部区域提供标准面

积100cm2左右重量型样本:茎/花药/根系,提供最低重量5g左右(关键:保持形态完整防碎)

角质组分(酯类、酸类、酮类烃类、醛类、酰胺类、萜类、醇类、脂肪酸类)

GC-MS

经典脂质组学(甘油磷脂[GP]、甘油酯[GL]、鞘脂[SP]、异戊烯醇脂[PR]、甾醇酯[ST、]脂肪酰基[FA])

合计54w+


HPLC-MSMS

动物细胞/细菌1*107

血清/血浆100μL

尿液100μL

组织50mg

粪便/肠道内容物50mg

细胞培养液/发酵液/瘤胃液/卵泡液等100μL

植物样本(冻干粉)50mg

定量脂质

6k

动物定量脂质:甘油磷脂[GP]、甘油酯[GL]、鞘脂[SP]、异戊烯醇脂[PR]、甾醇酯[ST]、脂肪酰基[FA]

总计5400+,包含44个亚类
HPLC-MSMS

植物定量脂质:

甘油磷脂[GP]、

甘油酯[GL]、

鞘脂[SP]、

异戊烯醇脂[PR]、

脂肪酰基[FA]

总计6200+,包含39个亚类

广靶代谢组学

PRM植物精准广靶

HPLC-MSMS

鲜样≥5g;

冻干样≥1g

干样≥2g

10mL常规液体:每组至少做3次生物学重复,才可做组学分析

PRM花青素精准广靶(花青素类、花白素类、原花青素类)

PRM多酚精准广靶(酚酸、黄酮类、间苯三酚类、木脂素)

PRM木脂素精准广靶(二苄基丁烷类木脂素、二苄基丁酰内酯类木脂素、芳基萘木脂素及芳基四氢萘木脂素、联苯环辛二烯类木脂素、呋喃木脂素、呋喃型木脂素、新木脂素类)

PRM萜类精准广靶(单萜类、倍半萜类、二萜类、三萜类、类胡萝卜素(C40型)、脱辅基类胡萝卜素、杂萜、甾体)

PRM生物碱精准广靶(色氨酸系生物碱、酪氨酸系生物碱、赖氨酸系生物碱、鸟氨酸系生物碱、邻氨基苯甲酸生物碱、组氨酸系生物碱、烟酸系生物碱)

PRM香豆素精准广靶(简单香豆素类、呋喃并香豆素类、吡喃香豆素类、异香豆素)

PRM黄酮类精准广靶(黄酮类、黄酮醇类、黄烷酮、二氢黄酮醇、黄烷-3-醇类、查耳酮类、异黄酮类、紫檀素类)

转录组学

真核转录组测序

针对转录产物mRNA进行高通量测序

Illumina测序/华大平台测序

除去培养基,收集菌体后,立即液氮速冻

 

原核转录组测序

针对转录产物mRNA进行高通量测序

Illumina测序3Gb常规分析

 

案例展示

 

指标含义

高通量靶向代谢:针对已知目标代谢物,采用三重四极杆质谱等平台,进行精准、绝对定量的检测,高效解析植物生长调控、品质形成、抗逆响应的物质基础

非靶代谢组学:无偏向性地全面扫描样本中所有可检测的小分子代谢物,完整呈现植物内源性代谢物的全景图谱,最大程度挖掘未知代谢物,发现潜在生物标志物与新功能成分。

广靶代谢组学:融合靶向与非靶向的优势,基于自建大数据库,对数千种已知代谢物进行高覆盖、半定量/准确定量的检测技术,兼顾广度与灵敏度。可快速筛选差异代谢物,为后续靶向验证、机制研究提供核心数据支撑

转录组学:通过高通量测序,全面检测样本中所有基因的表达水平,解析基因的转录活性与调控网络,精准定位与目标性状(抗逆、品质、药效等)相关的关键功能基因。

 

植物多组学分析
代谢组学分析依托高分辨质谱,精准定量植物内源激素、酚酸、黄酮、氨基酸等各类小分子代谢物,直观呈现生理表型对应的物质基础。转录组测序,全面检测样本中所有基因的表达水平,快速定位与目标性状(如抗逆、品质、药效)相关的关键功能基因与调控通路。
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