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项目文章(IF=7.4)|浙江农林大学吴家胜课题组探索香榧中氨基酸生物合成途径和调控机制

浏览: 发表时间:2023-11-21 10:06:52

香榧是一种珍稀的坚果,富含多种生物活性物质,其中包括多种对人体有益的氨基酸。氨基酸是构成蛋白质的基本单元,也是人体代谢的重要物质。但是,T. grandis中氨基酸的组成和生物合成的分子机制还不清楚。

近日,浙江农林大学吴家胜课题组在Food Chemistry(IF=7.4)上发表文献Identification of key genes contributing to amino acid biosynthesis in Torreya grandis using transcriptome and metabolome analysis,文章主要探索了香榧中氨基酸生物合成途径和调控机制。

研究使用转录组和代谢组联合分析的方法,对香榧的籽粒进行了全面的研究。


研究内容

通过代谢组分析,研究利用LC-MS/MS-based代谢谱分析方法,鉴定出了28种香榧籽粒中的氨基酸,并对各氨基酸含量随生育期变化进行了测定。

通过转录组分析,总共有267个单基因编码28种酶,通过代谢组分析28种代谢物(包括氨基酸及其衍生物)参与氨基酸合成。

对这些基因和氨基酸之间的相关性进行了分析,发现了4个基因与至少10种氨基酸有显著的正相关性。这些基因分别编码了DAHP合成酶(DAHP)、天冬氨酸合成酶(ASA)、柠檬酸合成酶(CITS)。这些酶是参与芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)生物合成的重要酶。科学家们还从这4个基因中克隆了2个基因(TgDAHP2和TgASA1)的完整编码序列。并通过转化拟南芥的方法,通过比较转基因拟南芥与WT的氨基酸含量,发现这两个基因的过表达可以提高拟南芥中氨基酸的含量。

通过亚细胞定位证明2个基因(TgDAHP2和TgASA1)均定位于香榧籽粒细胞的叶绿体上


通过双荧光素酶分析,进一步研究发现编码赤霉素响应蛋白的基因TRINITY_DN101774_c0_g1及编码生长素响应蛋白的基因TRINITY_DN115535_c1_g2等可以激活TgASA1的表达.



小结

研究对T. grandis氨基酸生物合成的初步探索,为揭示T. grandis的营养价值和生物活性提供了新的线索。同时,这项研究也展示了转录组和代谢组分析在植物功能基因组学中的应用价值。

该研究署名南京瑞源生物(检测子公司:南京维百瑞检测)进行氨基酸含量检测,氨基酸组分检测分为游离氨基酸检测及结合氨基酸检测,结合氨基酸指构成蛋白质的氨基酸,一般只检测17种,游离氨基酸指以氨基酸单体的形式游离在细胞中,参与代谢的氨基酸,一般检测31种。


服务流程

样本要求

-80℃保存,干冰运输


服务优势

1、三重四级杆——线性离子阱复合质谱系统,灵敏的定量系统,可以快速准确的,对复杂基质中的多种待测物定量。具有分析范围广、分离能力强、定性分析结果可靠、检测限低、分析时间快等特点。

2、每年更换一根色谱柱,以保证分离、分析效果。

3、样品上机前会先跑标准品,标准品数据没有问题才会上样。

项目文章(IF=7.4)|浙江农林大学吴家胜课题组探索香榧中氨基酸生物合成途径和调控机制
香榧是一种珍稀的坚果,富含多种生物活性物质,其中包括多种对人体有益的氨基酸。氨基酸是构成蛋白质的基本单元,也是人体代谢的重要物质。但是,T. grandis中氨
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